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簡便化サービス
>> 作業負担の軽減とコスト削減を実現するWebアプリケーションを開発・ご提供しますシミュレーション科学者にとっては、シミュレーションを実施する作業全体にわたって手間・コストを削減することが肝要です。そのためには、シミュレーション環境をより最適化することが求められます。シミュレーションプログラム本体の高速化については弊社の各種サービスにて承っていますが、シミュレーションプログラムを利用する環境について、例えば次のような問題を抱えていらっしゃいませんか？
・入出力ファイルを手作業を修正していて、やる度に大きな手間がかかって困る！もっと楽にできないものか？
・コマンドを打ち込むのに毎回手間がかかって困る（ときどき打ち間違える…）！もっと楽にできないものか？
本サービスでは、こうした負担を解消すべく、プログラムの利用環境を簡便化するアプリケーションを開発いたします。
作成するソフトウェアは、基本的にWebブラウザでLAN内のどこからでもアクセスでき、簡単に使えるグラフィカルユーザーインターフェイスを備えたWebアプリケーションとなります。もし、高度なユーザーインターフェイスが不要な際は、コマンドラインで実行できるスクリプトの開発も可能ですので、併せてお問い合わせください。
簡便化事例のご紹介
連成分子化学計算プラットフォーム「Hybrid QM/MD Platform」の開発
HPCシステムズと岡山理科大学 直島研究室の共同研究の下、 研究室の生体・基質分子計算フローをシステム化し、誰でも簡単にAmber・Gaussian といった複数の計算プログラムを使える計算プラットフォーム「Hybrid QM/MD Platform」 を開発いたしました。本プラットフォームの特徴は、次の利便性を得られる点です。
| * コマンドインタフェースからの脱却 | 計算コマンドを隠蔽し、見つけにくい入力間違いを防止します。 |
| * 連成計算に対応 | 分子動力学計算・量子化学計算を連結した計算を構成・自動実行できます。 |
| * ファイル修正の自動化 | 数千行ものファイルを手作業で修正する手間を自動化により大幅低減します。 |
| * 計算機間の自動負荷分散 | バッチジョブシステムTORQUEに対応。計算機の性能を最大限引き出します。 |
| * 計算データの一元管理 | 実行した全ての入出力ファイルに迅速にアクセスできる一元管理インタフェースを提供します。 |
| * 計算機のクラウド化 | どこにいてもWebブラウザ経由でアクセスして化学計算を行えます。Windows/Mac/Linux対応。 |
本プラットフォームは、日本でユーザの多いAmber分子化学計算プログラムにおいて使用時常に直面する問題が解決された点で意義深いものです。
■ダウンロード資料
●分子化学計算のための簡便な連成計算プラットフォームの開発/プレスリリース
●簡便で高速なシミュレーション環境を目指して/第29回日本シミュレーション学会大会発表資料
■デモ公開Amber9ライセンスをお持ちの方に限り、本プラットフォームをデモ公開させていただきます(Webブラウザでアクセスいただけます)。 お試しになりたい方は、お問い合わせください。
